Molypden có một số trạng thái ôxi hóa phổ biến là +2, +3, +4, +5 và +6. Trạng thái ôxi hóa cao nhất là phổ biến trong molipđen(VI) oxit (MoO3) trong khi hợp chất với lưu huỳnh thông thường nhất là molipđen(IV) sunfua (MoS2). Khoảng rộng các trạng thái ôxi hóa thuộc về các clorua của molypden:

• Molipđen(II) clorua MoCl2 (chất rắn màu vàng),
• Molipđen(III) clorua MoCl3 (chất rắn màu đỏ sẫm),
• Molipđen(V) clorua MoCl5 (chất rắn màu lục sẫm),
• Molipđen(VI) clorua MoCl6 (chất rắn màu nâu),

Giống như crom và một số kim loại chuyển tiếp khác, molypden có khả năng tạo ra các liên kết bậc bốn.